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Résumés CPLF 2026 

Variations bi-alléliques de LAMP3 associées à une pneumopathie interstitielle diffuse : une maladie liée au surfactant

Résumé PO09-297
Nathan N.1,2 ; Desroziers T.1 ; Soreze Y.1,3 ; Delgado Rodriguez M.1 ; Thomas L.1 ; Nau V.4 ; Dastot-Le Moal F.4 ; Bernstein JA.5 ; Cole FS.6 ; Damme M.7 ; Fischer A.8 ; Griese M.9 ; Hinds D.8 ; Keehan L.5 ; Milla C.5 ; Mohammad H.10 ; Rips J.10 ; Wambach JA.6 ; Wegner DJ.6 ; Amselem S.1,4 ; Legendre M.1,4 ; Giurgea I.1,4 ; Athina Karabina S.1 ; Breuer O.10 ; Coulomb l’Herminé A.11 ; Louvrier C.1,4
1Sorbonne University, Inserm UMR\_S933 Laboratory of childhood genetic diseases, Armand Trousseau Hospital, Paris, France ; 2Assistance Publique Hôpitaux de Paris, Pediatric Pulmonology department, Reference Centre for rare lung diseases (RespiRare), Armand Trousseau Hospital, Paris, France ; 3Assistance Publique Hôpitaux de Paris, Intensive Care Unit, Armand Trousseau Hospital, Paris France ; 4Assistance Publique Hôpitaux de Paris, Medical Genetics Department, Armand Trousseau Hospital, Paris France ; 5Department of Pediatrics, School of Medicine, Stanford University, Stanford, CA, USA ; 6Edward Mallinckrodt Department of Pediatrics, Washington University in St. Louis School of Medicine, ; 7Christian-Albrechts-University Kiel, Biochemical Institute, Kiel, Germany ; 8University of Iowa, Department of Pediatrics, Iowa City, IA, United States ; 9Department of Pediatric Pneumology, Dr von Hauner Children's Hospital, Ludwig-Maximilians-University, German Center for Lung Research, Munich, Germany. ; 10Hadassah Hebrew University Medical Center, Jerusalem, Israel ; 11Assistance Publique Hôpitaux de Paris, Pathology Department, Sorbonne University, Armand Trousseau Hospital, Paris, France

Auteur correspondant : NATHAN N. 


Introduction

Le gène LAMP3 code pour la protéine lysosomal membranaire 3. Ce gène, exprimé au niveau pulmonaire dans les cellules alvéolaires de type II (AEC2), a été récemment suggéré comme gène candidat de développement de pneumopathie interstitielle diffuse (PID) lié au métabolisme du surfactant pulmonaire, mais sans études fonctionnelles réalisées. Deux variants hétérozygotes ont été identifiés au laboratoire chez un patient avec un diagnostic de PID à 9 ans. L’objectif de cette étude était de caractériser les deux variants identifiés, ainsi que le variant rapporté dans la littérature et d’identifier l’implication de LAMP3 dans le métabolisme du surfactant pulmonaire.

Méthodes

Les variants de LAMP3 ont été identifiés par séquençage d’exome. Les études ex vivo ont permis d’étudier l’expression des ARNm à partir de brossage nasal et de tissu pulmonaire, ainsi que l’expression de la protéine par immunohistochimie sur biopsie pulmonaire. In vitro, la localisation subcellulaire de LAMP3 étudiée par immunofluorescence et son expression par western blot, ont été analysées après expression transitoire dans la lignée A549. Enfin les interactions entre LAMP3 et les protéines du surfactant (SP)-B et SP-C ont été évaluées par co-immunoprécipitation.

Résultats

L’enfant, un garçon de 15 ans atteint de PID, était hétérozygote composite pour deux variants de LAMP3 : p. (Tyr302Glnfs*2) et p. (Thr268Met). Les études ex vivo de l’ARNm ont montré une dégradation des transcrits portant la variant décalant le cadre de lecture par probable nonsense-mediated mRNA decay (NMD). L’immunohistochimie sur biopsie pulmonaire du patient a confirmé une diminution globale de l’expression de LAMP3. In vitro, les études fonctionnelles de la variation T268M et de la variation G288R précédemment rapportée n’ont pas révélées de défaut de localisation subcellulaire de LAMP3. L’étude de l’expression de ces variations a montré une diminution significative des protéines mutées par rapport à la forme sauvage de la protéine (WT). De plus, la protéine T268M présentait un poids moléculaire plus bas que la forme WT en western blot. L’étude de N-glycosylation de la variation T268M, a confirmé un défaut de glycosylation. Le lien entre LAMP3 et le surfactant pulmonaire a été mis en évidence par l’interaction de la protéine avec SP-B et SP-C. De plus une quantité plus importante de pro-SP-B et pro-SP-C a été détectée après précipitation avec LAMP3 T268M en comparaison avec le WT.

Conclusion

Cette étude a permis de mettre en évidence le caractère pathogène des deux variants retrouvé chez un patient atteint de PID précoce. Les liens étroits entre LAMP3 et le métabolisme des surfactants pourraient expliquer la physiopathologie de cette maladie. L’ensemble de ces résultats permettent d’impliquer le gène LAMP3 dans les PID.

Références

[1] Louvrier C. et al. Bi-allelic LAMP3 variants in childhood interstitial lung disease : a surfactant-related disease. EBioMedicine. 2025 Mar : 113 : 105626

[2] Rips J. et al. Unbiased phenotype and genotype matching maximizes gene discovery and diagnostic yield. Genet Med. 2024 Apr ; 26(4):101068

[3] Dillard K. et al. Recessive missense LAMP3 variant associated with defect in lamellar body biogenesis and fatal neonatal interstitial lung disease in dogs. PLoS Genet. 2020 Mar 9 ; 16(3):e1008651


Nathan N. * ; Desroziers T. * ; Soreze Y. * ; Delgado Rodriguez M. * ; Thomas L. * ; Nau V. * ; Dastot-Le Moal F. * ; Bernstein JA. * ; Cole FS. * ; Damme M. * ; Fischer A. * ; Griese M. * ; Hinds D. * ; Keehan L. * ; Milla C. * ; Mohammad H. * ; Rips J. * ; Wambach JA. * ; Wegner DJ. * ; Amselem S. * ; Legendre M. * ; Giurgea I. * ; Athina Karabina S. * ; Breuer O. * ; Coulomb l’Herminé A. * ; Louvrier C. *
*Déclarent ne pas avoir de lien d'intérêt en rapport avec ce résumé.

 


Avec le soutien institutionnel du laboratoire GlaxoSmithKline GSK